Stanice Palmovka leží pod ulicí Na Žertvách, de facto v linii bývalé železniční tratě z Vysočan přes zastávku Libeň, dolní, na jejímž místě je křižovatka Zenklova (protínající křižovatku ze severu k jihu), na západ Libeňský most a na východ už zmíněná ulice Na Žertvách. Jde o oblast Prahy 8, dolní Libně (Horní Libeň je Balabenka a dál k Harfě). Je zde velký dopravní uzel, hlavně tramvajový.